GRIPE ¿Y TÚ DE QUIEN ERES?

https://www.heraldo.es/noticias/suplementos/tercer-milenio/innovacion/2018/02/19/gripe-quien-eres-1223985-2121030.html

CLONACIÓN ÁCIDOS NUCLEICOS (ACTIVIDAD PADLET)

CLONACIÓN ÁCIDOS NUCLEICOS

MÉTODOS DE SECUENCIACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS

La secuenciación de los ácidos nucleicos es el proceso de determinación de la secuencia de nucleótidos que componen una molécula de ADN o de ARN y que se representa por las iniciales de las bases nitrogenadas que portan.

Evolutivamente, desde los inicios de las técnicas de hibridación a principios de los 80, hasta la actualidad se han desarrollado las siguientes técnicas:

• Técnicas manuales basadas en reacciones químicas o enzimáticas (Maxam y Gilbert/Sanger).
• Secuenciaciones automáticas basadas en el método de Sanger ( 1ª, 2ª y 3ª generación) ; obtención de electroferogramas.
• Pirosecuenciación ( Detección óptica)

                                      MÉTODO DE MAXAM Y GILBER

Secuenciación química de Maxam-Gilbert. El fragmento de ADN que se desea secuenciar se desnaturaliza (1), se marca el extremo 5' con radiactividad (2), la muestra se divide en cuatro alícuotas que son tratadas con diferentes reactivos químicos que cortan al ADN en bases específicas (A, t, C, G) (3), en cada alícuota, queda una colección de fragmentos de ADN de diferente tamaño que termina en una base específica. Los fragmentos se separan electroforéticamente en un gel de poliacrilamida (4) y se visualizan y analizan por medio de una radiografía (5). 

Secuenciación de Sanger y Pirosecuenciación

ELECTROFEROGRAMAS

 Interpretación de electroferogramas

PIROSECUENCIACIÓN 

                                              Secuenciación de alto rendimiento

PADLET PCR

                                               https://padlet.com/biomolab12/p338locwhtes

EL GEN VIKINGO Y LA RESISTENCIA AL VIH

Desde 1988 se festeja el 1 de diciembre de manera anual el día mundial del HIV (por sus siglas en inglés: virus de la inmunodeficiencia humana)/síndrome de inmunodeficiencia adquirida (SIDA). Según estadísticas de la Organización Mundial de la Salud, se estima que en el año 2012 más de 35 millones de personas en el mundo están infectadas con este virus.

Las personas se infectan con bacterias, virus, hongos y parásitos, pero algunas se enferman más que otras cuando tienen contacto con estos microorganismos.

Diferentes mutaciones (alteraciones) de genes afectan como una persona se infecta mas fácilmente, mientras que otra es resistente a la infección, o sea, no se infecta. Aunque los factores ambientales también juegan un rol, el objetivo de estudio en múltiples laboratorios de investigación del mundo es identificar genes que participan en este mecanismo para desarrollar medicamentos que puedan bloquear o retrasar una infección.

Desde la década de 1980 cuando el HIV fue descubierto por Luc Montagnier y Francoise Barré-Sinuossi, ganadores del Premio Nobel de Medicina (2008), hay millones de personas en todo el mundo que están enfermas con el SIDA causada por el virus HIV. Lo sorprendente es que no todas las personas expuestas al virus se enferman. Los científicos han estudiado cuidadosamente las personas que parecieran ser resistentes a la infección por el HIV.

Diferentes grupos científicos intrigados con este fenómeno, analizaron y estudiaron como el HIV interactúa con las células de nuestro cuerpo. El HIV entra a nuestro organismo a través de relaciones sexuales no protegidas (sin preservativo) o con la utilización de agujas como en el caso de las drogas ilegales.

A nivel molecular, el HIV entra a ciertas células de nuestro cuerpo utilizando los llamados receptores, ciertas proteínas especiales que están localizadas en el exterior de todas células. Los receptores tienen la función de ser como un ‘’una puerta de entrada’’. Cuando tienen contacto con una molécula, generalmente otra proteína, transmiten el mensaje hacia el interior de la célula, lo que se denomina una transducción de una señal. El HIV infecta a los seres humanos ingresando a los linfocitos T (glóbulos blancos que forman parte del sistema inmune y son los encargados con otras células del sistema inmune de normalmente combatir los microorganismos) a través de su receptor denominado CD4. La evolución normal de la enfermedad hace que el HIV luego de infectar a los linfocitos T CD4 normalmente los destruye y afecta al sistema inmune en general causando las infecciones que caracterizan a este síndrome.

Se ha demostrado que para que el HIV finalmente pueda infectar los linfocitos T necesita la presencia de otro receptor llamado CCR5. La acción en conjunto de los receptores CD4 y CCR5 es la verdadera ‘’puerta de entrada’’ permitiendo el ingreso del HIV a la célula, y de esa manera, poder infectar los linfocitos T.

Las personas resistentes a la infección por HIV tienen una mutación (alteración) en el gen CCR5 (localizado en el brazo corto (p) del cromosoma 3: 3p21) llamada CCR5-delta32. El resultado de la mutación CCR5-delta32 es la formación (síntesis) de una proteína que no es funcional, o sea, el receptor no cumple su función normalmente. Eso significa que uno de los componentes de la ‘’puerta de entrada’’ no funciona, y por ende, el HIV no va a poder entrar a los linfocitos, y, como consecuencia no va a poder infectarlos.

Las personas que tienen 2 copias del gen CCR5 mutado (alterado) con la variación llamada delta32 son inmunes a la infección por el HIV. Esto significa que si una persona tiene sus 2 copias del gene CCR5 mutadas no se va a infectar con el HIV. Este sorprendente fenómeno no es infrecuente, ya que ocurre en aproximadamente 1% de las personas de raza blanca (descendientes de Europa del Norte, caucásicos). Una teoría sugiere que esta mutación se originó en Escandinavia (Dinamarca, Noruega y Suecia) y migró hacia el sur de Europa con las invasiones que realizaron los vikingos de acuerdo al estudio publicado por Novembre y colaboradores en la revista PLoS Biol (2005). Hay otro fenómeno biológico que también es interesante mencionar. Cuando la persona solo tiene una copia del gen CCR5 con la mutación delta32, la persona se infecta con el HIV, pero según diferentes estudios científicos pareciera ser menos probable su progresión al cuadro más grave, el SIDA. Esta situación es más frecuente, ya que se encuentra en hasta el 20% de las personas de origen caucásico de acuerdo a los estudios de Ioannidis y Marmor publicados en las revistas Ann Intern Med (2001) y J Urban Health (2006), respectivamente.

En la actualidad se realizan varios test genéticos para el diagnóstico y la determinación del pronóstico de varias enfermedades. Pero, no es necesario que la población se haga una prueba genética para determinar si es portador (“carrier”) de la mutación CCR5-delta32, ya que el virus en algunos casos puede utilizar otros receptores como mecanismos de infección.

Un concepto y recomendación importante: que una persona sea resistente a la infección por HIV porque tiene los 2 genes CCR5 mutados, no significa que no deba cuidarse con preservativo, ya que otros genes y proteínas pueden facilitar la entrada del virus a los linfocitos T. Aunque la medicina avanza, y estos hallazgos son realmente increíbles, el mensaje es claro, todas las personas deben seguir tomando medidas de protección para evitar una infección con este virus.